Мир до нас: Новый взгляд на происхождение человека
Шрифт:
91
Slon, V. et al. 2017. A Fourth Denisovan Individual. Science Advances 3(7): e1700186.
92
«Денисова 1», маленький сломанный зуб, сначала опознали как первый верхний человеческий резец. Однако повторные анализы показали, что он принадлежал крупному парнокопытному, возможно бизону. См.: Viola, B. et al. 2011. Late Pleistocene Hominins from the Altai Mountains, Russia. In A. P. Derevianko and M. V. Shunkov (eds.), Characteristic Features of the Middle to Upper Paleolithic Transition in Eurasia, Novosibirsk: SB-RAS, pp. 207–13.
93
Weber, A. W. et al. 2006. Radiocarbon Dates from Neolithic and Bronze Age Hunter-Gatherer Cemeteries in the Cis-Baikal Region of Siberia. Radiocarbon 48(1): 127–66.
94
Hofreiter, M. et al. 2004. Lack of Phylogeography in European Mammals Before the Last Glaciation. Proceedings of the National Academy of Sciences 101(35): 12963–8.
95
Несмотря на то что кости на участке раскопок нередко оказываются раздробленными, все же удается установить их принадлежность более чем к 25 видам крупных млекопитающих и более чем к 100 видам мелких позвоночных, таких как птицы, рыбы, земноводные и пресмыкающиеся. Русские ученые реконструировали местные природные условия, исследуя типы мелких млекопитающих и птиц, которые живут в наши дни на различных высотах альпийских и субальпийских областей Алтая. Отлавливая животных, обитающих сегодня в разных экотонах, они изучили климатические и природные предпочтения современной фауны. Сравнив эти данные с выявляемыми археологами распределениями костей и пыльцы, ученые могут установить вероятные типы природных условий в различные доисторические периоды.
96
Hagelberg, E., Hofreiter, M. and Keyser, C. 2015. Ancient DNA: The First Three Decades. Philosophical Transactions of the Royal Society B 370: 2013.0371.
97
Cooper, A. and Poinar, H. N. 2000. Ancient DNA: Do It Right or Not at All. Science 289:1139.
98
Madison, P. 2016. The Most Brutal of Human Skulls: Measuring and Knowing the First Neanderthal. British Journal for the History of Science 49(3): 411–32.
99
Cooper, A. et al. 2001. Human Origins and Ancient Human DNA. Science 292: 1655–6.
100
Dabney, J., Meyer, M. and Paabo, S. 2013. Ancient DNA Damage. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 5(7): a012567. https://doi.org/10.1101/cshperspect.a012567.
101
Gansauge, M.-T. and Meyer, M. 2014. Selective Enrichment of Damaged DNA Molecules for Ancient Genome Sequencing. Genome Research 24(9): 1543–9.
102
Korlevic, P. et al. 2015. Reducing Microbial and Human Contamination in DNA Extractions from Ancient Bones and Teeth. BioTechniques 59(2): 87–93.
103
Муллис был интересной и непростой личностью. Он утверждал, что в его работе очень важную роль играли вещества, а в автобиографии «Пляски нагишом на поле разума» (Dancing Naked in the Mind Field) писал о том, как встретил возле своей лесной хижины зеленого енота в перчатках, вероятно пришельца из иных миров, который поприветствовал его словами: «Добрый вечер, доктор». Идея ПЦР пришла к нему в виде классического озарения в духе «Эврика!», когда поздно ночью он ехал из Беркли в свою хижину по калифорнийской автостраде 128. Он съехал на обочину около столба с обозначением «миля 46.58» и записал свои мысли, пока его девушка спала на соседнем сиденье. Он понял, что метод ПЦР может открыть широчайшие перспективы, так как позволяет амплифицировать огромное количество ДНК. В ту ночь он решил, что когда-нибудь непременно получит Нобелевскую премию за свое открытие. Увы, заключительный этап его научной карьеры был отмечен отрицанием климатических изменений и ложной идеей о том, что ВИЧ не порождает СПИД.
104
Green, R. E. et al. 2010. A Draft Sequence of the Neandertal Genome. Science 328: 710–22.
105
Общее описание см. здесь: www.yourgenome.org/facts/what-is-the-454-method-of-dna-sequencing.
106
Rasmussen, M. et al. 2010. Ancient Human Genome Sequence of an Extinct Palaeo-Eskimo. Nature 463: 757–62.
107
Olalde, I. et al. 2018. The Beaker Phenomenon and the Genomic Transformation of Northwest Europe. Nature 555: 190–96.
108
Paabo, S. 2014. Neanderthal Man: In Search of Lost Genomes. New York: Basic Books.
109
Там же.
110
Krause, J. et al. 2010. The Complete Mitochondrial DNA Genome of an Unknown Hominin from Southern Siberia. Nature. 464: 894–7.
111
Reich, D. et al. 2010. Genetic History of an Archaic Hominin Group from Denisova Cave in Siberia. Nature 468: 1053–60.
112
Meyer, M. et al. 2012. A High-Coverage Genome Sequence from an Archaic Denisovan Individual. Science 338: 222–6. В геномах с высоким покрытием последнее обычно бывает больше 20X. Среди древних геномов рекорд принадлежит шведскому мезолитическому геному с археологической стоянки Стора Фёрвар, покрытие которого составляет 70X (Torsten Gunther et al., PLoS Biology 2018). Среди наших древнейших палеолитических образцов особняком стоит кость «алтайского неандертальца», «Денисова 5», по которой был составлен геном с выдающимся покрытием в 52X. Такого уровня не достигает даже большинство геномов с высоким покрытием, составленных для наших современников. Например, геном Крейга Вентера, руководителя одной из двух групп, соревновавшихся за первенство в деле секвенирования человеческого генома, имеет покрытие всего лишь 7,5X.
113
Green, R. E. et al. 2010. A Draft Sequence of the Neandertal Genome. Science 328: 710–22.
114
Bennett, E. A. et al. 2019. Morphology of the Denisovan Phalanx Closer to Modern Humans Than to Neanderthals. Science Advances, 4 сентября 2019 г.: eaaw3950.
115
Meyer et al. 2012.
116
Prufer, K. et al. 2017. A High-Coverage Neandertal Genome from Vindija Cave in Croatia. Science 358: 655–8.
117
Green et al. 2010.
118
Reich, D. et al. 2010.
119
Sawyer, S. et al. 2015. Nuclear and Mitochondrial DNA Sequences from Two Denisovan Individuals. Proceedings of the National Academy of Sciences 112: 15696–700.